歐洲生物資訊研究所（EMBL-EBI，全稱EMBL - European Bioinformatics Institute），是一個政府間國際組織的學術機構，致力於以資訊學手段解答生命科學問題。該所建立於1994年，位於英國劍橋南部的維康信託基因園，是歐洲分子生物學實驗室（EMBL，全稱European Molecular Biology Laboratory）的一部分。
歐洲生物資訊研究所為科學界提供免費生物資訊資源、促進基礎研究、提供培訓和傳播行業尖端技術。歐洲生物資訊研究所管理和維護著多個大型生物資訊公共資料庫， 跨基因組學，蛋白質組學，化學資訊學，轉錄組學，系統生物學等，同時創建了多種工具供讓研究人員分析和分享資訊。歐洲生物資訊研究所提供最優質的研究環境、無數跨學科的合作機會以及遍及世界各地的培訓課程。
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